Durante la época romana se llamó “Portus Albus” y la existencia de una importante colonia romana ha sido atestiguada por los hornos de cerámica que han sido encontradas y que datan del siglo I después de Cristo. Esta colonia romana languideció hasta que con la llegada de los musulmanes, que la nombraron con “Al-Yazirat Al-Jadra” fue conquistada para los musulmanes por Tarik en el año 711 y si bien en un primer momento fue una pequeña población en los años en los cuales los musulmanes se aposentaron en ella se amuralló y se erigió un alcázar y una mezquita, esta última por orden de Ben Jalid. Con posterioridad Yusuf añadió lo que se dio en llamar “Villa Nueva” en el siglo XIII. Almanzor, caudillo que llevó el Islam hasta los pirineos, nació en esta localidad en el año 939.
Alfonso XI puso sitio a la plaza en el año 1.432 y después de 20 meses de asedio logró hacerse con la misma el 28 de marzo del año 1.344 que coincidió que se celebraba la festividad del Domingo de Ramos. Para conmemorar la efeméride la mezquita paso a estar bajo la advocación cristiana a Santa María de Palma.
La villa volvió a perderse para la cristiandad cuando en 1.369 Mohamed V de Granada ante la falta de protección que tenía la localidad la asedia y la vuelve a recuperar para el Islam, provocando una desbandada de la población quedando únicamente algunas chozas de pescadores aunque con la posterior reconquista Enrique IV dio un tratamiento especial a la ciudad conseguir repoblarla.
En el año 1.704 la ciudad, debido al ataque de una escuadra anglo – holandesa pierde definitivamente el peñón de Gibraltar que hasta estos momentos sigue bajo la soberanía británica. Los gibraltareños, tras la derrota se refugian en la ermita de San Roque y algunos otros optan por avencidarse en Algeciras, produciéndose una revitalización de la ciudad.
El año 1.850 se celebra por primera vez la feria de Algeciras y con posterioridad la celebración de una conferencia internacional sobre Marruecos hace que por toda la península se extienda la imagen de Algeciras como una ciudad hospitalaria y culta. Otro de los hitos que favorecerán la estampa de ciudad moderna es que en el año 1.913 se comenzará a construir el puerto de la ciudad. Finalmente, en el acervo popular se conocerá la ciudad como “la ciudad de la bella bahía”.